在《寂静岭:暴雨》中你将扮演一个正在被押送去新监狱的囚犯Murphy Pendleton。押运囚犯的巴士在途中出事,车上的大多数人都死于事故中,而Murphy则被带到了阴森的小镇——寂静岭。游戏中会零散的交代Murphy的背景和过去,你会慢慢的知道Murphy被监禁的原因以及他为什么会被寂静岭选中。一开始你只会看到奇怪的线索,但随着剧情的发展,这些零星的线索便开始串联在一起。
游戏中会有一些需要家做出选择的剧情来让你创造Murphy的人物性格。好几次你会被问道是否救别人或者不管他们(偶尔也会教唆别人)。但是这些选择并不会影响剧情的发展。本作的敌人在寂静岭系列中并没多少创意。